เริ่มก่อสร้าง ปี 2551 มีพื้นที่ใช้สอย 1,344.00 ตร.ม. ลักษณะอาคารคอนกรีตเสริมเหล็กสูง 2 ชั้น สถาบันขงจื่อมหาวิทยาลัยสวนดุสิต สุพรรณบุรี ได้รับการสนับสนุนจากกระทรวงศึกษาธิการของจีนผ่านสำนักงานส่งเสริมการเรียนการสอนภาษาจีนนานาชาติ หรือ HANBAN ได้มอบอำนาจให้มหาวิทยาลัยสวนดุสิต จัดตั้งสถาบันขงจื่อมหาวิทยาลัยสวนดุสิต สุพรรณบุรี ตั้งอยู่ที่มหาวิทยาลัยสวนดุสิต วิทยาเขตสุพรรณบุรี และได้รับความร่วมมือจากมหาวิทยาลัยกวางสี เป็นมหาวิทยาลัยคู่สัญญา มีพิธีเปิดอย่างเป็นทางการ เมื่อวันที่ 27 ธันวาคม พ.ศ. 2549 โดยมี ฯพณฯ บรรหาร ศิลปอาชา นายกรัฐมนตรีคนที่ 21 ของประเทศไทย เป็นประธานในพิธีเปิด ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2559 ตามมาตรา 66 เล่มที่ 132 ของกฎการเปลี่ยนชื่อที่ประกาศโดยมหาวิทยาลัยสวนดุสิตในปี 2559 ชื่อของสถาบันได้เปลี่ยนจาก “สถาบันขงจื่อ มหาวิทยาลัยราชภัฏสวนดุสิต สุพรรณบุรี” เป็น “สถาบันขงจื่อ มหาวิทยาลัยสวนดุสิต สุพรรณบุรี”

ปัจจุบันสถาบันขงจื่อ สุพรรณบุรี มีอาคารสำนักงานเฉพาะและจัดตั้งศูนย์แสดงนิทรรศการวัฒนธรรมจีนและศูนย์การเรียนรู้วัฒนธรรมจีนอย่างต่อเนื่อง โดยมีห้องเรียนขงจื่อ 1 แห่ง ศูนย์การเรียนรู้ภาษาจีน 5 แห่ง ศูนย์สอบวัดระดับความรู้ภาษาจีน (HSK HSKK YCT) 30 แห่ง มีโรงเรียนในความร่วมมือในเขตภาคกลางและภาคตะวันตกของประเทศไทยจำนวน 60 แห่ง พร้อมมีครูชาวจีนสอนภาษาจีน 3 คน อาจารย์อาสาสมัครชาวจีน 3 คน และจ้างครูไทยนอกเวลา 2 คน เพื่อรับผิดชอบการสอนภาษาจีนของสถาบันขงจื่ออย่างเต็มที่